Кафедра природничих наук і методик їхнього навчання утворена на факультеті математики, природничих наук та технологій 01 серпня 2022 року (відповідно до наказу ректора Центральноукраїнського державно педагогічного університету імені  Володимира Винниченка №69/1-ун від 28 квітня 2022 року про реорганізацію факультетів та кафедр університету) об’єднанням двох кафедр факультету: кафедри фізики, біології та методик їхнього навчання, а також кафедри природничих наук, хімії, географії та методик їхнього навчання.

Кафедра фізики, біології та методик їхнього навчання була створена під час реорганізації та об’єднання двох факультетів: фізико-математичного та природничо–географічного (відповідно до наказу ректора Центральноукраїнського державно педагогічного університету імені  Володимира Винниченка №118/1-ун від 10 серпня 2021 року про реорганізацію факультетів та кафедр університету), з 01 вересня 2021 року  були об’єднані кафедри фізики та методики її викладання, а також біології та методики її викладання. Цим же наказом була утворена кафедра природничих наук, хімії, географії та методик їхнього навчаннявнаслідок об’єднання кафедри природничих наук та методики їхнього навчання та кафедри географії та геоекології.

До об’єднання та реорганізації це були окремі кафедри двох факультетів:

• фізики та методики її викладання;
• біології та методики її викладання;
• географії та геоекології;
• природничих наук та методики їхнього навчання.